AMI-keskus tarjoaa käyttäjilleen useita ohjelmistoja aineiston analysointiin. Alla luetellut ohjelmistot ovat laajassa käytössä kampuksen alueella, ja siksi niihin löytyy vertaistukea helposti AMI:n muista käyttäjistä. Ohjelmia on mahdollista käyttää myös AMI-keskuksen työasemilla.
Ärsykkeiden tuottamisessa AMI-keskuksessa on käytössä: